Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms