Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP6P35125 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP6P35125 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP6P35125 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP6P35125 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP6P35125 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP6P35125 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP6P35125 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP6P35125 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP6P35125 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP6P35125 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP6P35125 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP6P35125 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP6P35125 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP6P35125 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP6P35125 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP6P35125 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP6P35125 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP6P35125 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP6P35125 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP6P35125 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
USP6P35125 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
USP6P35125 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP6P35125 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP6P35125 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP6P35125 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP6P35125 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP6P35125 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP6P35125 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP6P35125 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP6P35125 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP6P35125 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP6P35125 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP6P35125 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP6P35125 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP6P35125 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP6P35125 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP6P35125 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP6P35125 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP6P35125 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP6P35125 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP6P35125 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP6P35125 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP6P35125 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP6P35125 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP6P35125 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
USP6P35125 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP6P35125 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP6P35125 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP6P35125 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP6P35125 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP6P35125 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP6P35125 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP6P35125 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP6P35125 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP6P35125 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP6P35125 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP6P35125 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP6P35125 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP6P35125 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP6P35125 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms