Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM5P33992 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM5P33992 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM5P33992 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM5P33992 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM5P33992 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM5P33992 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM5P33992 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM5P33992 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM5P33992 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM5P33992 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM5P33992 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM5P33992 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MCM5P33992 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM5P33992 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM5P33992 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM5P33992 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms