Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFNP31947 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFNP31947 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFNP31947 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFNP31947 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFNP31947 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFNP31947 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFNP31947 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFNP31947 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFNP31947 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFNP31947 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFNP31947 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms