Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms