Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms