Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms