Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms