Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTSSP25774 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTSSP25774 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTSSP25774 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTSSP25774 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTSSP25774 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTSSP25774 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTSSP25774 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTSSP25774 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTSSP25774 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTSSP25774 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTSSP25774 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTSSP25774 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSSP25774 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms