Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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