Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK11BP21127 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms