Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF3P20783 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NTF3P20783 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NTF3P20783 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NTF3P20783 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NTF3P20783 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NTF3P20783 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NTF3P20783 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NTF3P20783 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NTF3P20783 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NTF3P20783 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF3P20783 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms