Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDSP20132 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDSP20132 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDSP20132 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDSP20132 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDSP20132 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDSP20132 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDSP20132 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDSP20132 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDSP20132 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDSP20132 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDSP20132 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSP20132 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDSP20132 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDSP20132 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDSP20132 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDSP20132 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDSP20132 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDSP20132 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDSP20132 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDSP20132 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SDSP20132 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDSP20132 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDSP20132 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms