Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms