Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPI1P17947 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPI1P17947 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPI1P17947 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPI1P17947 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms