Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2A2P16615 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms