Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSP16219 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSP16219 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSP16219 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms