Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSPP15924 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSPP15924 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSPP15924 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSPP15924 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms