Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH1P12830 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH1P12830 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH1P12830 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH1P12830 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH1P12830 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH1P12830 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH1P12830 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH1P12830 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH1P12830 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH1P12830 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms