Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms