Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms