Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP3A4P08684 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP3A4P08684 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP3A4P08684 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP3A4P08684 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP3A4P08684 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP3A4P08684 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP3A4P08684 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms