Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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