Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPBP07199 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPBP07199 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPBP07199 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPBP07199 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPBP07199 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPBP07199 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPBP07199 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPBP07199 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPBP07199 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPBP07199 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPBP07199 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPBP07199 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPBP07199 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPBP07199 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPBP07199 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPBP07199 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPBP07199 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPBP07199 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPBP07199 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPBP07199 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPBP07199 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPBP07199 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPBP07199 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPBP07199 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPBP07199 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPBP07199 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms