Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNP04198 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNP04198 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYCNP04198 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYCNP04198 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYCNP04198 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYCNP04198 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYCNP04198 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYCNP04198 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYCNP04198 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYCNP04198 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYCNP04198 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYCNP04198 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYCNP04198 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYCNP04198 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYCNP04198 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYCNP04198 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYCNP04198 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNP04198 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYCNP04198 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYCNP04198 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYCNP04198 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYCNP04198 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYCNP04198 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MYCNP04198 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MYCNP04198 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYCNP04198 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms