Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms