Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms