Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms