Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFRP00533 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFRP00533 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFRP00533 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EGFRP00533 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EGFRP00533 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EGFRP00533 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EGFRP00533 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EGFRP00533 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFRP00533 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms