Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD4O95243 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD4O95243 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD4O95243 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD4O95243 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD4O95243 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD4O95243 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD4O95243 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD4O95243 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD4O95243 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MBD4O95243 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MBD4O95243 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MBD4O95243 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD4O95243 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD4O95243 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD4O95243 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD4O95243 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD4O95243 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD4O95243 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD4O95243 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD4O95243 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD4O95243 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD4O95243 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms