Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms