Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF40AO75400 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF40AO75400 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms