Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP5O75197 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRP5O75197 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP5O75197 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP5O75197 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP5O75197 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP5O75197 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP5O75197 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP5O75197 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP5O75197 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP5O75197 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP5O75197 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP5O75197 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP5O75197 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP5O75197 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP5O75197 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP5O75197 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP5O75197 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRP5O75197 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRP5O75197 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRP5O75197 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRP5O75197 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRP5O75197 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms