Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms