Protein–RNA interactions for Protein: O60683

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX10O60683 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX10O60683 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX10O60683 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX10O60683 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX10O60683 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX10O60683 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms