Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms