Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms