Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCO2O43819 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCO2O43819 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCO2O43819 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCO2O43819 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCO2O43819 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCO2O43819 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms