Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRNO43815 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRNO43815 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRNO43815 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRNO43815 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRNO43815 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRNO43815 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRNO43815 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRNO43815 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRNO43815 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRNO43815 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRNO43815 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
STRNO43815 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRNO43815 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRNO43815 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms