Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms