Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms