Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA2O43364 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA2O43364 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA2O43364 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA2O43364 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms