Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRXO43186 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRXO43186 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRXO43186 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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