Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms