Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms