Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39AO00148 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms