Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms