Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PMD0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PMD0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PMD0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PMD0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PMD0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PMD0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PMD0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PMD0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PMD0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PMD0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PMD0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PMD0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PMD0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PMD0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PMD0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PMD0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PMD0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PMD0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms