Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms