Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00473A8K010 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00473A8K010 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00473A8K010 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00473A8K010 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00473A8K010 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00473A8K010 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00473A8K010 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00473A8K010 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00473A8K010 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00473A8K010 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms